ในระหว่างที่มังกรได้หายไปกว่าหนึ่งพันปีมนุษย์ได้เกิดภ้ยพิบัติครั้งใหญ่ ทำให้วิทยาการต่างๆถูกลบออกเกือบหมด แต่ว่ามนุษย์นั้นก็ได้สร้างประเทศขึ้นมาใหม่จากสมองของพวกเขา ส่วนวิทยาการในอดีตจะเรียกว่าอะติแฟลก

วันหนึ่งมีประเทศได้คิดค้นวิธีสร้างมังกรขึ้นมาได้สำเสร็จ แต่ว่าพวกเขากลับใช้สิ่งมีชีวิตนี้ในการยึดครองโลก ทำให้แต่ล่ะประเทศตกเป็นอาณานิคมอย่างง่ายดาย ด้วยเหตุนี้หญิงสาวชื่อมาลินและพรรคพวกจึงเดินทางเพื่อตามหามังกรในอดีตเพื่อขอความช่วยเหลือ

แล้วความพยายามของมาลินก็เป็นจริง เธอได้หลุดเข้าไปยังสถานที่สวยงามท่ามกลางธรรมชาติซึ่งมีมังกรตัวใหญ่บินเล่นอยู่บนท้องฟ้า ทำเอาเธอกลัวขาสั่นจนสลบไปทั้งที่จะมาขอความช่วยเหลือแท้ๆ

ผ่านไปได้ไม่นานหญิงสาวได้ตื่นขึ้นมาในห้องนอนแห่งหนึ่ง เมื่อกวาดสายตาไปรอบๆก็พบมนุษย์สามคนซึ่งหนึ่งในนั้นคือเจ้าของฟาร์มมังกรมีชื่อว่า"ทินโด" มาลินได้เล่าทุกอย่างให้เขาฟังจนได้รับความช่วยเหลือจากฟาร์มมังกรคือ การให้มังกรหนุ่มเพิ่งเกิดใหม่ชื่อ"มาอุ"ลงไปช่วยพวกเขาเพียงตนเดียว

แต่ทว่าเจ้าของฟาร์มมังกรเองก็แอบลงมาพร้อมกับมังกรของเขาซึ่งไม่รู้ว่ามีจำนวนเท่าไหร่ ส่วนประเทศที่สร้างมังกรขึ้นมาดูเหมือนว่าพวกเขาจะมีมังกรอยู่ในมือกว่าพันตัว และแล้วสงครามระหว่างมังกรก็กำลังจะเริ่มขึ้น